Les fossiles de Patagonykus présentent des similitudes avec ceux d'Alvarezsaurus et de Mononykus. Comme pour de nombreux autres membres de la famille des Alvarezsauridae, les bras des Patagonykus ont été considérablement raccourcis et les mains ont été presque entièrement réduites à une seule grande griffe chacune. Patagonykus a peut -être utilisé cette griffe pour rechercher des insectes ou des termites derrière l'écorce des arbres ou dans un sol dur.
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