La particularité du Miragaia était le long cou, composé d'au moins 17 vertèbres. Miragaia possédait donc plus de vertèbres cervicales que la plupart des sauropodes. Seuls les sauropodes Euhelopus, Mamenchisaurus et Omeisaurus découverts en Chine avaient autant de vertèbres cervicales que Miragaia. Comme son parent, le stégosaure, le bout de sa bouche était édenté. Comme tous les stégosaures connus, Miragaia possédait une série de plaques, d'épines et de plaques cutanées ossifiées (ostéodermes) sur la peau. Les chercheurs ont également reconstruit huit paires de plaques triangulaires disposées de manière asymétrique avec un extérieur convexe et un intérieur concave le long de la ligne médiane du cou et de la colonne vertébrale dorsale.
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