Longtemps considéré comme un Ceratosaure, Alvarezsaurus est maintenant considéré comme un Maniraptora primitif (groupe des Maniraptoriformes). Ses vertèbres ressemblent à celles des Ornithomimidae. Il était bipède, possédait une longue queue, un long cou, de petites pattes antérieures et des pattes postérieures dégarnies. Vu sa physionomie, ce dinosaure devait être taillé pour la course. Les bras se terminaient par une seule grosse griffe et deux petits doigts, peut-être pour chercher des insectes dans les termitières ou sous l'écorce des arbres.
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