En 1992, le squelette d'un ornithopode a été trouvé lors de l'expédition sino-japonaise dans les montagnes Mazong Shan à Gansu . En 1997, le chercheur chinois Lü Junchang a nommé la découverte comme un troisième type de Probactrosaurus : Probactrosaurus mazongshanensis. Cependant, il est vite devenu clair que le fossile était un animal entièrement différent. En 2014, Gongpoquansaurus a été décrit scientifiquement par You Hailu, Li Daqing et Peter Dodson. Le nom générique fait référence au bassin de Gongpoquan, la formation géologique dans laquelle le fossile a été découvert. Gongpoquansaurus était un hadrosaure de construction robuste d'une longueur estimée à environ six mètres. La forme de son crâne était similaire à celle d' Equijubus, qui a été trouvée dans la même formation, mais ses dents rappellent davantage celles d' Altirhinus.
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