C’était le premier crâne complet de sauropode du Crétacé découvert en Amérique. Il est remarquable pour ses dents étroites, alors qu'elles sont d'habitude plus larges chez les brachiosauridés. Bien que Abydosaurus ait vécu quelque 45 millions d'années après le genre Giraffatitan, les deux crânes sont similaires, à part les dents plus étroites et plus pointues et le nez plus petit d’Abydosaurus. Abydosaurus peuvent se différencier de tous les autres sauropodes, y compris Giraffatitan, par des caractéristiques subtiles de l'os nasal et maxillaire, ses narines relativement petites et certaines caractéristiques de ses dents.
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