En 1895, Richard Lydekker a donné à une nouvelle espèce le nom de Bothriospondylus madagascariensis basé sur des fossiles de Madagascar, auquel son nom générique fait également référence. Cependant, comme il n'y avait aucun lien vérifiable avec Bothriospondylus suffosus, le paléontologue argentin José Fernando Bonaparte a nommé Lapparentosaurus en tant qu'espèce distincte en 1986. Le nom générique honore le paléontologue français Albert-Félix de Lapparent. L'holotype est constitué de deux arcs vertébraux. Tout le matériel fossile se compose de trois ou quatre squelettes partiels sans crânes d'individus juvéniles.
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