Le nom générique fait référence à l'endroit où il a été trouvé, El Chocón. L'épithète spécifique rend hommage au géologue Bailey Willis, qui a enregistré la stratification de la zone entre 1910 et 1914. L'holotype de ce titanosaure consiste en un squelette incomplet sans crâne. Diverses parties du dinosaure ont été découvertes lors des fouilles, environ 25% de l'ensemble du squelette. Les pièces les plus importantes sont un ensemble presque complet de vertèbres, une grande partie de l'épaule droite et du bras droit. Avec ces fossiles, la nouvelle espèce a été décrite. D'autres os ont également été découverts, des dents, des parties du crâne, du cou et de la queue. Choconsaurus a formé le squelette le plus complet d'un titanosaure basal en 2017.
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